4 Western blot数据分析
Western Blot即蛋白免疫印迹,行话常常将其称为WB,是将细胞或组织总蛋白质通过电泳从凝胶转移到固相支持物NC膜(硝酸纤维素薄膜)或PVDF(聚偏二氟乙烯膜)膜上,然后用特异性抗体检测某特定抗原的技术。
1:目的的蛋白是否存在于某样品
2:表达情况,上调还是下调?比如正常和疾病组织之间的差异
1 提取总蛋白
对于悬浮细胞:离心收集细胞,轻轻vortex或者弹击管底以把细胞尽量分散开。按比例加入裂解液。轻弹管底以充分裂解细胞。充分裂解后应没有明显的细胞沉淀。
组织:组织称重,玻璃匀浆器匀浆,或使用手持式组织研磨仪研磨,或使用超声破碎仪,直至充分裂解。也可以把组织样品冷冻后液氮研磨,研磨充分后加入裂解液进行裂解。按比例加入裂解液,超声破碎,离心4 °C,12000g,20min,取上清。
1:会涉及到提取核蛋白和膜蛋白
2:裂解液的选择
步骤:
1:配置分离胶,灌分离胶,
加水隔绝空气,等待凝固后,在水和分离胶中间会出现分界线,然后倒掉水。
2:配置浓缩胶,灌浓缩胶
3:上样
上样的总蛋白在20-50ug,尽量保证上样量以及体积一致。
4:电泳 电泳条件根据目的蛋白进行适度调整
一般恒压80-120V
制备凝胶中的要点
• AP要新鲜配制;
• 混合搅拌速度太快易产生气泡影响聚合, 导致电泳带畸形,太慢不均匀;
• 分离胶勿倒的过满,需留一定的空间;
• 凝胶需缓慢凝固,TEMED、AP用量过多会导致胶太硬, 从而电泳时易烧胶
• 保持所有装置清洁;
• 试剂要有正确的pH值,及妥当的保存
转膜后确认:
丽春红染色,属于可逆染色,检测转膜效率,与下游的WB检测无影响。
转膜的注意事项
封闭前
封闭后
备注:
为了获得最佳的实验效果,需要参考抗体的说明进行预实验,以达到最好的检测效果。
快速(一种抗体)
没有二抗交叉反应引起的非特异性条带,无信号二级放大免疫反应性降低
间接法:
额外的二抗孵育以及条件优化 ,信号放大灵敏度高(多个二抗 结合位点)
阳性对照:检测一抗是否有表达
阴性对照:检测一抗特异性
空白对照:不加一抗,只加二抗,检测二抗是否有交叉反应
内参的选择
常见问题
1.条带向上弯曲,呈笑脸状,凝胶制备不均匀,中间冷却不好,制胶缓冲液,电泳缓冲液,30%丙烯酰胺溶液。
2.条带向下弯曲,呈皱眉状,可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,制胶缓冲液,电泳缓冲液,30%丙烯酰胺溶液。
膜再生
安全问题