科研星球

Western blot原理及应用

Western blot原理及应用



1 Western blot概念


2 Western blot实验流程


3 Western blot样本准备


4 Western blot数据分析

5 Western blot常见问题及解决方案


Western blot概念


Western Blot即蛋白免疫印迹,行话常常将其称为WB,是将细胞或组织总蛋白质通过电泳从凝胶转移到固相支持物NC膜(硝酸纤维素薄膜)或PVDF(聚偏二氟乙烯膜)膜上,然后用特异性抗体检测某特定抗原的技术。

为什么要做Western blot


1:目的的蛋白是否存在于某样品

2:表达情况,上调还是下调?比如正常和疾病组织之间的差异

Western blot实验流程


1 提取总蛋白

细胞:对于贴壁细胞:去除培养液,用PBS、生理盐水或无血清培养液洗一遍(如果血清中的蛋白没有干扰,可以不洗)。按比例加入裂解液。用枪吹打数下,使裂解液和细胞充分接触。


对于悬浮细胞:离心收集细胞,轻轻vortex或者弹击管底以把细胞尽量分散开。按比例加入裂解液。轻弹管底以充分裂解细胞。充分裂解后应没有明显的细胞沉淀。

组织:组织称重,玻璃匀浆器匀浆,或使用手持式组织研磨仪研磨,或使用超声破碎仪,直至充分裂解。也可以把组织样品冷冻后液氮研磨,研磨充分后加入裂解液进行裂解。按比例加入裂解液,超声破碎,离心4 °C,12000g,20min,取上清。

1:会涉及到提取核蛋白和膜蛋白

2:裂解液的选择

2 总蛋白浓度测定


为了保证每孔的蛋白上样量一致,结果才具有可比性。一般的方法有nano drop分光光度计测量,BCA法等。


3 SDS-PAGE


凝胶电泳:是在PAGE凝胶中引进SDS(十二烷基磺酸钠,含有大量带负电荷的SO32-)由于结合大量带负电荷的SDS,蛋白质本身带有的电荷被掩盖,蛋白质在SDS-PAGE胶中的迁移率主要取决于其分子量的大小。


步骤:

1:配置分离胶,灌分离胶,

wxsync-2020-08-b4b442b68eb97398c1379dc23e7b8025.jpeg 


wxsync-2020-08-293a1d8a513654c53a8750fa4bd2caa9.jpeg

加水隔绝空气,等待凝固后,在水和分离胶中间会出现分界线,然后倒掉水。

2:配置浓缩胶,灌浓缩胶

wxsync-2020-08-d8d49c528ad22b834de5e6653e6c723c.png

3:上样

上样的总蛋白在20-50ug,尽量保证上样量以及体积一致。

wxsync-2020-08-93e355dfb35b76fffd02bbb32dcaa3d2.png

4:电泳  电泳条件根据目的蛋白进行适度调整

一般恒压80-120V

制备凝胶中的要点

• AP要新鲜配制;

• 混合搅拌速度太快易产生气泡影响聚合, 导致电泳带畸形,太慢不均匀;

• 分离胶勿倒的过满,需留一定的空间;

• 凝胶需缓慢凝固,TEMED、AP用量过多会导致胶太硬, 从而电泳时易烧胶

• 保持所有装置清洁;

• 试剂要有正确的pH值,及妥当的保存

wxsync-2020-08-492a928f01b4387acc421d36375d1d65.png

wxsync-2020-08-bd22bac202eaae42fc96cf7fb3300c0d.png

wxsync-2020-08-c74bbb49c7c80e2ca1febb8c5e6db137.png

wxsync-2020-08-1d111f9c12e4ed68a3318e36432dc88d.png

wxsync-2020-08-2892b80fa8ebc042fc9a8d869288adf8.png

4 转膜


wxsync-2020-08-388c997aff68829656826b8822de67a8.png

wxsync-2020-08-8e4c0f26eeaa2e077ce7b6f7dd0ca273.png

wxsync-2020-08-42df9d79c86324dcc435f39ab8ef8752.png

转膜后确认:

丽春红染色,属于可逆染色,检测转膜效率,与下游的WB检测无影响。

wxsync-2020-08-3a1c6dd2c7425b9f758389dcc9750870.png

转膜的注意事项

wxsync-2020-08-271cde8640693bb3f3d3cbad48930d5b.png

5 封闭


封闭作用:避免膜上的蛋白和一抗发生非特异性结合,导致非特异性背景高,需要对膜上潜在的结合位点进行封闭处理,一般使用5%的脱脂奶粉或者3%的BSA室温封闭1h-2h,或者37度封闭1h,或者4度过夜。


wxsync-2020-08-324bea6b28a060e2a8fcbb9566643a4c.png

封闭前

wxsync-2020-08-f06d427969f9fd290e01ab81d87f596d.png

封闭后

6 孵育一抗


一抗:根据研究的目的蛋白名称查找相应的抗体确定抗体检测的种属:人.小鼠.大鼠等


 

wxsync-2020-08-c57b18f1d5575ef24aae2dd46c1540e4.png

 

7 孵育二抗


二抗:根据一抗物种进行选择。如抗大小鼠,抗兔,抗人,抗山羊等


 

wxsync-2020-08-9d834c11fb503a15ba490f956349f600.png

备注:

为了获得最佳的实验效果,需要参考抗体的说明进行预实验,以达到最好的检测效果。

8 检测及分析


常用ECL检测:一般使用的发光液A和B分别是鲁米诺和过氧化氢,在二抗上偶联的辣根过氧化物酶(HRP)的催化作用下,发生化学反应,发出荧光,同各国设备检测。


wxsync-2020-08-6c5e16f6b9dd11c398b9d717efad6ec8.png

直接法、间接法


直接法:


快速(一种抗体)

没有二抗交叉反应引起的非特异性条带,无信号二级放大免疫反应性降低

间接法:

额外的二抗孵育以及条件优化 ,信号放大灵敏度高(多个二抗 结合位点)

对照设置


内参对照:β-Actin,β-tubulin,Gapdh


阳性对照:检测一抗是否有表达

阴性对照:检测一抗特异性

空白对照:不加一抗,只加二抗,检测二抗是否有交叉反应

内参的选择

wxsync-2020-08-ffcad31e12f9ca1877427c56ab276121.png
目的蛋白分子量            相差5KD以上


常见问题

wxsync-2020-08-8b4e7f261974661b9f0bc56bd4b619a3.png

wxsync-2020-08-dac04549ff6203bb79d841ef401e6a48.png

信号弱或者无信号


wxsync-2020-08-1c8a71f23fed7ad9253ba57ae3808d2b.pngwxsync-2020-08-40ad29f697f839d150be08e847074028.png
高背景


wxsync-2020-08-5c8001f8345df815c17a6defc8eee97c.pngwxsync-2020-08-e564fa19f6d28f7a19ec750aa7e16149.png
条带位置不对或有非特性条带


wxsync-2020-08-aa918a699711021a9b737aa9b3b99dba.png

wxsync-2020-08-6c5ff4baaa44bd7905372afde0d1b4fb.png

条带弯曲


1.条带向上弯曲,呈笑脸状,凝胶制备不均匀,中间冷却不好,制胶缓冲液,电泳缓冲液,30%丙烯酰胺溶液。

2.条带向下弯曲,呈皱眉状,可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,制胶缓冲液,电泳缓冲液,30%丙烯酰胺溶液。

wxsync-2020-08-07604438281eec8bb3dc0a10e0cd470a.png


膜再生

wxsync-2020-08-83677bd4c22ef24d2cdc1853e5e0b47d.png

安全问题

wxsync-2020-08-a78c538c4ccaeeb995aa82ccd6d0ef80.png



没有账号?